Google, par la voix de Gary Illyes, a indiqué qu'il faut absolument recharger le fichier de désaveu de liens (si vous en avez un bien sûr) en cas de migration d'un site HTTP vers HTTPS. En effet, il suffit de retourner dans la Google Search Console pour renvoyer à nouveau le fichier avec la bonne URL, cette fois-ci en HTTPS...
@AnnieCushing @MattNorman_90 okay, checked with the team: yes, you need to reupload the disavow file to the https site profile in SC.
— Gary Illyes (@methode) 13 Octobre 2015
Pour ceux qui ne le sauraient peut-être pas encore, le fichier de désaveu de liens permet de lutter contre Google Penguin en général, en indiquant une liste de liens ou de domaines que Google ne doit pas prendre en compte parmi les liens entrants (backlinks) qui pointent vers un site. Ainsi, vous "nettoyez" votre profil de liens en lui indiquant ceux qui ne vous semblent pas judicieux.
Mon objectif n'est pas de rentrer dans le débat infini autour de ces désaveux de liens entrants et de Google Penguin, mais juste de préciser qu'une migration d'un site HTTP vers HTTPS doit être bien menée de bout en bout. Au-delà de ce nouveau chargement du fichier de désaveu dans la Google Search Console, d'autres problèmes courants se retrouvent souvent. Par exemple, les webmasters oublient généralement de modifier l'URL du fichier Sitemap XML dans le fichier robots.txt, laissant l'ancien HTTP en avant. Attention donc à ces quelques détails fâcheux pour le référencement... :D